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普通转录组,单细胞转录组,空间转录组区别❓

看到一篇今年新发表在cell上的空间转录组的文章~跟大家分享一下,图太好看了,这就是💰的魅力叭…[哭惹R] ➡️然后顺便说一下三种转录组的区别在哪里❓ (普通转录组,空间转录组,单细胞转录组) ✅主要在于分辨率和分析维度的不同。 🌟1、普通转录组获得的是混合细胞的基因平均表达水平,单细胞转录组是通过对单个细胞的人为标记,可以获得群体内单个细胞的基因表达谱,有助于发现新细胞,挖掘细胞的异质性,而空间转录组则是直接在组织原位上进行mRNA捕获,能够同时获取细胞的空间位置信息和基因表达数据,从而进一步推动对组织原位细胞基因表达的研究❗️ 🌟2、类比一下就是👇🏼 -普通转录组:混合果汁,可以尝出果汁味道,但是味道具体来源哪种水果,不得而知。 -单细胞转录组:水果沙拉,可以尝出不同水果的味道,也可以看到都有什么水果。 -而空间转录组:水果蛋糕,不仅能尝出味道,看到有什么水果,水果具体摆放位置也是清清楚楚。 ✅实际应用中如何选择❓ 🌟1、样本需求:普通转录组样本兼容性最好,只要RNA质量合格就行;单细胞转录组需要制备出大小,活性,浓度都符合要求的单细胞悬液;而空间转录组则是主要处理组织切片。 🌟2、研究目的:普通转录组:适用于主效应的挖掘,筛选出关键差异基因,单细胞转录组和空间转录组:更精细化,不同处理的细胞类型及其分析特征,或者了解不同空间区域特性。 🌟3、科研预算:这个没啥可说的啦~那如何去分析结果数据呢❓ ➡️推荐有需要的宝尝试了解一下华哥的课程,可以vx🔍“华哥包教包会”,尊嘟很值得信任~[害羞R] 华哥是中大博士毕业的导师,成立了自己的团队,目前已经教学【空间转录组】这块5年之久,带过的学员已发表CNS 7篇,子刊➕一区文章90多篇❗️ ➡️国内20多个院士团队都有他的学员,赵恒教授也是,太厉害了。🫠 ➡️而且交流起来是一个很负责任,和蔼可亲的老师,课程也都是他亲自教学的,包教包会,都包的❗️ ➡️P8、9、10简单罗列了一下华哥【空间转录组】的课程,除此之外也有单细胞转录组,入门生信的,这里没有一一赘述~ 总之,🈶想学习的UU可以去详细了解一下哦[喝奶茶R]