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⚠️RNA测序就看这篇!(样本要求➕结果分析)

之前做过转录组测序好几次,结果都挺好的~无论是样品质控还是数据方面。 ✅样本要求: 1、送样之前先做预实验,做同样的处理做RT-PCR鉴定一下预测目的基因是否work,如果是补数据则做这一步,如果是没有前期研究,直接做转录组测序的不用做预实验,直接送样即可。 2、1个组最少2个副孔,一组3个重复样本,防止数据偶然性。 3、无论细胞系敏感性和目的蛋白丰度相差较大的还是相差较小的,都建议送两个细胞系测序。 4、送测序可以是细胞,也可以是自己提取RNA,建议送全细胞➕Trizol,自己提取RNA的话容易降解,结果可能不是特别理想。 ✅结果文档主要看哪里? 主要看enrichment里的三个数据库分析结果(GO,KEGG,GSEA)以及assembl里的质控(看副孔一致性,其实热图也可间接看出) ✅结果分析: 本文涉及的测序结果数据解读: 气泡图 火山图 热图 GSEA图 GO通路(CC,MF,BP) KEGG通路(pathway涉及到的各种路线符号基本解读) ✅测序excel差异基因汇总表: 如何寻找目的蛋白发挥某个功能的相关基因? 可看目的基因GO序列号,寻找序列一样的。(如7图所示) ps:由于最近小偷太多,本人老被恶意搬运5555,之后图片都会打码哦[飞吻R]