1950年，毛人凤告诉蒋介石，吴石是地下党，蒋介石大惊，有些难以置信，他连问了两遍：“你确定是吴石？参谋次长吴石？”
1950年，中共台湾工委书记蔡孝乾被捕。
敌人对蔡孝乾进行搜身的时候，从他身上搜出了一个笔记本，笔记本上面出现了三个字——“吴次长”。
特务头子谷正文看到这三个字，第一时间想到了时任国民党国防部中将参谋次长的吴石将军。
难道，吴石将军也是地下党？
据谷正文所知，吴石可不简单。吴石原来在保定军校第三期学习，在校期间，不管是平时的考试还是毕业考试，吴石的成绩总是第一名。毕业后，吴石前往日本留学，先后考入了日本炮兵学校和日本陆军大学。
在这两所学校，吴石的成绩也是第一名。回国后，吴石在国民党陆军大学担任多年教官，他钻研军事，写了不少军事著作，而且国民党很多高级将领都是吴石的学生，这也导致，吴石在国民党中有很多人脉。
国民党败退台湾后，蒋介石认为，吴石是如今台湾少有的军事人才，对他越来越器重，不仅授予吴石中将军衔，还让吴石担任国民党国防部参谋次长。
每次国防部召开会议，蒋介石总是会询问吴石的建议和想法，还经常采纳。这时候，台湾的很多国民党官员都知道，吴石将军是蒋介石身边的大红人。
身为特务头子的谷正文自然知道这一点，所以在没有确凿证据之前，他是绝对不敢擅自抓捕吴石的。
于是，谷正文就向毛人凤报告这件事情。
毛人凤听说吴石可能是地下党，也是大吃一惊，甚至一度怀疑这个消息是否属实，毛人凤想了想，决定暂时不向蒋介石报告。但毛人凤拿不定主意，就向国民党参谋总长周至柔汇报此事，请周至柔拿主意。
周至柔指示，吴石身份特殊，若没有确凿证据，不准动他，当务之急，是要找到吴石是地下党员的证据。
毛人凤就让谷正文展开调查。
谷正文就挑了一个时间，来到了吴石家里，这时，吴石不在家，家里只有他的夫人王碧奎。
谷正文谎称自己是吴石的老部下，言语中对吴石十分敬仰，这样，王碧奎也就没有那么警惕。两人开始闲聊起来，闲聊中，谷正文不断套取吴石最近的动向。
王碧奎没有防备，无意间说出了许多情报，其中就包括吴石与朱女士多次见面的事情。
这个朱女士，指的是华东局特派员朱枫。
吴石抵达台湾后，获取到了许多绝密情报，但由于敌人封锁得比较严，吴石没有办法把这些绝密情报送回大陆，在这种情况下，中共华东局就派了朱枫前往台湾，与吴石接头。朱枫抵达台湾后，先是与蔡孝乾取得联系，并在蔡孝乾的帮助下见到了吴石。
随后，朱枫就把吴石搜集到的大量绝密情报，全部送回大陆，这些情报甚至引起了毛主席的高度重视。
毛主席听说这是一位女特派员（朱枫）从一位国民党上层人士“密使1号”（吴石的代号）那里取回来时，当即嘱咐相关人员：“一定要给他们记上一功！”
之后，毛主席还挥毫写下一首诗：“惊涛拍孤岛，碧波映天晓。虎穴藏忠金，曙光迎来早。”
蔡孝乾叛变时，也说过朱枫与吴石见过面，如今王碧奎说两人确实见过面，谷正文确信，吴石肯定是地下党，他就把自己的发现告诉毛人凤。
毛人凤便找到蒋介石，把这一情况告诉他。
蒋介石大惊：“你说什么？吴石是地下党？”
毛人凤点了点头。
蒋介石见状，还是不太相信，又连续问了两遍：“你确定是吴石？是国防部的参谋次长吴石？”
“是参谋次长吴石。”毛人凤回答。
蒋介石沉默不语，好长时间没有说话，过了许久，他叹了叹气，无奈地说了两个字：“抓吧。”
1950年3月1日，一大群特务闯进了吴石家中，把吴石抓走了。在搜家的时候，特务发现了吴石签发给朱枫的特别通行证，特务根据这张特别通行证，在舟山群岛，把还没有撤回大陆的朱枫抓了。
随后，毛人凤整理好证据，并上报给蒋介石。
看着毛人凤递交上来的资料，蒋介石震怒不已，因为种种证据表明，吴石就是地下党员，他已经打入国民党内部多年了。一想到自己信任的人又是地下党，蒋介石就气得不行，他决定全程亲自督办“吴石案”。
1950年6月10日，蒋介石下令枪决吴石和朱枫。
当天，随着几声枪响，吴石和朱枫壮烈牺牲。
牺牲时，吴石56岁，朱枫45岁。
刽子手见吴石倒地不起，又走到他面前，对着他的遗体补了几枪，然后拍了一组照片，送到了蒋介石的办公桌上。这是蒋介石专门交代的事情——死要见尸。
